Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFC1P35251 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC1P35251 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC1P35251 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC1P35251 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC1P35251 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC1P35251 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFC1P35251 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFC1P35251 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFC1P35251 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFC1P35251 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms