Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD1P33897 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms