Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX2P32243 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX2P32243 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX2P32243 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX2P32243 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX2P32243 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX2P32243 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX2P32243 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX2P32243 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTX2P32243 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTX2P32243 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTX2P32243 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTX2P32243 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTX2P32243 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTX2P32243 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTX2P32243 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTX2P32243 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTX2P32243 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTX2P32243 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTX2P32243 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTX2P32243 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTX2P32243 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTX2P32243 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTX2P32243 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
OTX2P32243 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OTX2P32243 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms