Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC8P31273 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms