Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-FP30511 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms