Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIPP30301 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIPP30301 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIPP30301 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIPP30301 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MIPP30301 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MIPP30301 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MIPP30301 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIPP30301 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIPP30301 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIPP30301 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIPP30301 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIPP30301 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIPP30301 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIPP30301 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIPP30301 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIPP30301 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIPP30301 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIPP30301 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIPP30301 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIPP30301 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MIPP30301 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MIPP30301 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MIPP30301 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MIPP30301 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPP30301 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPP30301 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPP30301 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPP30301 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPP30301 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPP30301 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPP30301 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MIPP30301 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MIPP30301 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms