Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2E2P29084 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms