Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTFP26441 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTFP26441 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTFP26441 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTFP26441 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTFP26441 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTFP26441 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTFP26441 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTFP26441 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTFP26441 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTFP26441 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTFP26441 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTFP26441 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTFP26441 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTFP26441 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTFP26441 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTFP26441 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTFP26441 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTFP26441 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTFP26441 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTFP26441 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFP26441 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFP26441 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFP26441 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFP26441 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFP26441 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFP26441 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFP26441 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTFP26441 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTFP26441 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTFP26441 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTFP26441 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTFP26441 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTFP26441 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTFP26441 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTFP26441 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTFP26441 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTFP26441 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms