Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGA3P26006 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms