Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAX3P23760 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX3P23760 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX3P23760 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX3P23760 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX3P23760 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX3P23760 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX3P23760 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX3P23760 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX3P23760 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX3P23760 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX3P23760 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX3P23760 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX3P23760 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX3P23760 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX3P23760 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX3P23760 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX3P23760 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX3P23760 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX3P23760 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX3P23760 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX3P23760 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAX3P23760 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAX3P23760 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAX3P23760 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms