Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLDCP23378 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLDCP23378 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLDCP23378 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLDCP23378 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLDCP23378 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLDCP23378 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLDCP23378 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLDCP23378 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLDCP23378 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLDCP23378 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLDCP23378 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLDCP23378 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLDCP23378 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLDCP23378 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLDCP23378 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLDCP23378 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms