Protein–RNA interactions for Protein: P23248

RPS1B, 40S ribosomal protein S1-B, yeast

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	P23248	GCD6	YDR211W	2139 nt		2.8	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	SPS2	YDR522C	1509 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	MAD3	YJL013C	1548 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	YHR180W	YHR180W	492 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	PSR1	YLL010C	1284 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	RRT7	YLL030C	342 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	AHP1	YLR109W	531 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	UIP3	YAR027W	708 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	DIM1	YPL266W	957 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	UBP12	YJL197W	3765 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	CCT7	YJL111W	1653 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	PMR1	YGL167C	2853 nt		2.79	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	VPS27	YNR006W	1869 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	NEM1	YHR004C	1341 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	FUN30	YAL019W	3396 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	YDL183C	YDL183C	963 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	RPB7	YDR404C	516 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	COS12	YGL263W	1143 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	MRS3	YJL133W	945 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	ATP12	YJL180C	978 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	GMH1	YKR030W	822 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	MRPL16	YBL038W	699 nt		2.78	□□□□□ -1.96
RPS1B	P23248	TRE2	YOR256C	2430 nt		2.78	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	RGC1	YPR115W	3252 nt		2.78	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	DBP7	YKR024C	2229 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YCL075W	YCL075W	441 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YDR090C	YDR090C	933 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	RPL6A	YML073C	531 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	DGA1	YOR245C	1257 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	ALG11	YNL048W	1647 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	SIR1	YKR101W	1965 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	TOM1	YDR457W	9807 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	ISM1	YPL040C	3009 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YIL169C	YIL169C	2988 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	FAA2	YER015W	2235 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	NAM9	YNL137C	1461 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YKL222C	YKL222C	2118 nt		2.77	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	INP52	YNL106C	3552 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	SET4	YJL105W	1683 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	CCM1	YGR150C	2595 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	PAM1	YDR251W	2493 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	SDS23	YGL056C	1584 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	PPH3	YDR075W	927 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YGR107W	YGR107W	450 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	MRT4	YKL009W	711 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	GCD7	YLR291C	1146 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YOL035C	YOL035C	303 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YPL107W	YPL107W	747 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YBR053C	YBR053C	1077 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	PUF2	YPR042C	3228 nt		2.76	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	MIG1	YGL035C	1515 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YGL214W	YGL214W	486 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	RPS23A	YGR118W	438 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	THP2	YHR167W	786 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	PPX1	YHR201C	1194 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	GTT1	YIR038C	705 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YLR297W	YLR297W	390 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	DDI3	YNL335W	678 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	RPS23B	YPR132W	438 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YBR300C	YBR300C	498 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	ITC1	YGL133W	3795 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	BUD6	YLR319C	2367 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	NDT80	YHR124W	1884 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	CEX1	YOR112W	2286 nt		2.75	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	MSB2	YGR014W	3921 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	RPA190	YOR341W	4995 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	BNA4	YBL098W	1383 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	TLC1	TLC1	1301 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	VMA8	YEL051W	771 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	IRC18	YJL037W	675 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	HTA2	YBL003C	399 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	TEM1	YML064C	738 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	RPL19B	YBL027W	570 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	OCA2	YNL056W	594 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	SSU72	YNL222W	621 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	MDJ2	YNL328C	441 nt		2.74	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	TRM1	YDR120C	1713 nt		2.73	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	ATG13	YPR185W	2217 nt		2.73	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	ESL1	YIL151C	3357 nt		2.73	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	WHI4	YDL224C	1950 nt		2.73	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	SSO2	YMR183C	888 nt		2.73	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	SEC15	YGL233W	2733 nt		2.73	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	FRQ1	YDR373W	573 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YGL041W-A	YGL041W-A	465 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	ERG11	YHR007C	1593 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	YAL065C	YAL065C	387 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	PCD1	YLR151C	1023 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	NIT3	YLR351C	876 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	PRM15	YMR278W	1869 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	PEX11	YOL147C	711 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	SEC7	YDR170C	6030 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	SEC27	YGL137W	2670 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	ILS1	YBL076C	3219 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	ROG1	YGL144C	2058 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	TFC4	YGR047C	3078 nt		2.72	□□□□□ -1.97
RPS1B	P23248	FRE2	YKL220C	2136 nt		2.71	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.6 ms