Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD247P20963 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD247P20963 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD247P20963 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD247P20963 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD247P20963 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD247P20963 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD247P20963 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD247P20963 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CD247P20963 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD247P20963 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD247P20963 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD247P20963 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD247P20963 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD247P20963 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD247P20963 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD247P20963 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms