Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNB1P20700 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNB1P20700 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms