Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AMY2BP19961 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms