Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM21P19474 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM21P19474 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms