Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCLP19338 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCLP19338 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCLP19338 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCLP19338 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCLP19338 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NCLP19338 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCLP19338 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCLP19338 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCLP19338 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLP19338 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLP19338 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLP19338 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLP19338 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLP19338 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLP19338 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLP19338 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLP19338 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCLP19338 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCLP19338 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCLP19338 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCLP19338 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCLP19338 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCLP19338 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCLP19338 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCLP19338 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCLP19338 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCLP19338 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCLP19338 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCLP19338 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCLP19338 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCLP19338 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCLP19338 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCLP19338 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCLP19338 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCLP19338 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCLP19338 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCLP19338 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCLP19338 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCLP19338 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCLP19338 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCLP19338 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCLP19338 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLP19338 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLP19338 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLP19338 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLP19338 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLP19338 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLP19338 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLP19338 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLP19338 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms