Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI1P19237 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI1P19237 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms