Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT15P19012 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT15P19012 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT15P19012 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT15P19012 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT15P19012 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT15P19012 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT15P19012 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT15P19012 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT15P19012 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT15P19012 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT15P19012 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT15P19012 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT15P19012 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT15P19012 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT15P19012 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT15P19012 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT15P19012 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT15P19012 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT15P19012 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT15P19012 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT15P19012 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT15P19012 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KRT15P19012 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT15P19012 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT15P19012 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT15P19012 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT15P19012 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT15P19012 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT15P19012 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT15P19012 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT15P19012 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms