Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL17P18621 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL17P18621 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL17P18621 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL17P18621 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL17P18621 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL17P18621 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL17P18621 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL17P18621 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL17P18621 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL17P18621 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL17P18621 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL17P18621 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL17P18621 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL17P18621 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL17P18621 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL17P18621 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL17P18621 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL17P18621 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL17P18621 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL17P18621 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL17P18621 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL17P18621 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL17P18621 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL17P18621 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL17P18621 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL17P18621 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL17P18621 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL17P18621 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL17P18621 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPL17P18621 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPL17P18621 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL17P18621 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms