Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR1P18146 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EGR1P18146 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGR1P18146 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms