Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPI1P17947 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPI1P17947 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPI1P17947 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPI1P17947 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPI1P17947 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPI1P17947 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPI1P17947 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPI1P17947 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPI1P17947 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPI1P17947 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPI1P17947 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPI1P17947 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPI1P17947 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPI1P17947 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPI1P17947 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPI1P17947 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPI1P17947 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms