Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEBPBP17676 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEBPBP17676 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms