Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DESP17661 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DESP17661 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DESP17661 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DESP17661 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DESP17661 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DESP17661 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DESP17661 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DESP17661 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms