Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF4P15884 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF4P15884 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF4P15884 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF4P15884 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF4P15884 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF4P15884 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF4P15884 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF4P15884 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCF4P15884 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCF4P15884 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCF4P15884 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF4P15884 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF4P15884 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF4P15884 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF4P15884 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF4P15884 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCF4P15884 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCF4P15884 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCF4P15884 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCF4P15884 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCF4P15884 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms