Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DOBP13765 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-DOBP13765 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DOBP13765 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DOBP13765 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DOBP13765 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms