Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG2P13521 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG2P13521 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG2P13521 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG2P13521 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG2P13521 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG2P13521 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG2P13521 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG2P13521 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG2P13521 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG2P13521 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG2P13521 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG2P13521 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG2P13521 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG2P13521 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCG2P13521 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCG2P13521 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG2P13521 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG2P13521 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG2P13521 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG2P13521 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG2P13521 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG2P13521 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG2P13521 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG2P13521 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG2P13521 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG2P13521 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG2P13521 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG2P13521 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG2P13521 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG2P13521 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG2P13521 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG2P13521 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG2P13521 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG2P13521 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG2P13521 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG2P13521 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG2P13521 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG2P13521 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG2P13521 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG2P13521 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG2P13521 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG2P13521 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG2P13521 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms