Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL11A1P12107 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL11A1P12107 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms