Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT3P12035 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT3P12035 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT3P12035 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT3P12035 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT3P12035 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT3P12035 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT3P12035 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT3P12035 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT3P12035 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT3P12035 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT3P12035 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT3P12035 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT3P12035 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT3P12035 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT3P12035 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT3P12035 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT3P12035 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT3P12035 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT3P12035 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT3P12035 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms