Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MS4A1P11836 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MS4A1P11836 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MS4A1P11836 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MS4A1P11836 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MS4A1P11836 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MS4A1P11836 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MS4A1P11836 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MS4A1P11836 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MS4A1P11836 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MS4A1P11836 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MS4A1P11836 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms