Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1P11387 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1P11387 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1P11387 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1P11387 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1P11387 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1P11387 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1P11387 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1P11387 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1P11387 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1P11387 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOP1P11387 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOP1P11387 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms