Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNB1P11230 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNB1P11230 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms