Protein–RNA interactions for Protein: P11217

PYGM, Glycogen phosphorylase, muscle form, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGMP11217 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYGMP11217 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYGMP11217 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYGMP11217 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGMP11217 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGMP11217 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGMP11217 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGMP11217 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PYGMP11217 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PYGMP11217 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PYGMP11217 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYGMP11217 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGMP11217 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGMP11217 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGMP11217 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGMP11217 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGMP11217 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGMP11217 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PYGMP11217 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYGMP11217 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGMP11217 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGMP11217 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGMP11217 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGMP11217 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGMP11217 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGMP11217 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGMP11217 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGMP11217 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYGMP11217 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYGMP11217 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYGMP11217 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYGMP11217 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms