Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH3P11055 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH3P11055 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH3P11055 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYH3P11055 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYH3P11055 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYH3P11055 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH3P11055 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH3P11055 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH3P11055 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH3P11055 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH3P11055 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH3P11055 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH3P11055 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYH3P11055 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYH3P11055 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYH3P11055 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYH3P11055 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYH3P11055 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYH3P11055 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYH3P11055 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH3P11055 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH3P11055 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH3P11055 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH3P11055 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH3P11055 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH3P11055 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH3P11055 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYH3P11055 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYH3P11055 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYH3P11055 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYH3P11055 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYH3P11055 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYH3P11055 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYH3P11055 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYH3P11055 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MYH3P11055 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYH3P11055 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYH3P11055 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYH3P11055 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYH3P11055 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYH3P11055 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYH3P11055 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYH3P11055 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYH3P11055 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYH3P11055 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYH3P11055 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYH3P11055 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms