Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD1P0DJD0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD1P0DJD0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD1P0DJD0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms