Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2MP0CAP2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms