Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC175P0C221 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC175P0C221 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms