Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLA1P09884 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLA1P09884 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
POLA1P09884 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
POLA1P09884 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
POLA1P09884 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
POLA1P09884 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
POLA1P09884 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
POLA1P09884 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
POLA1P09884 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
POLA1P09884 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
POLA1P09884 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
POLA1P09884 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
POLA1P09884 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
POLA1P09884 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
POLA1P09884 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
POLA1P09884 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
POLA1P09884 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
POLA1P09884 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
POLA1P09884 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLA1P09884 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLA1P09884 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLA1P09884 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLA1P09884 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLA1P09884 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLA1P09884 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLA1P09884 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLA1P09884 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
POLA1P09884 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLA1P09884 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLA1P09884 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLA1P09884 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLA1P09884 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLA1P09884 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLA1P09884 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLA1P09884 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLA1P09884 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLA1P09884 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
POLA1P09884 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
POLA1P09884 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
POLA1P09884 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
POLA1P09884 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
POLA1P09884 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
POLA1P09884 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
POLA1P09884 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
POLA1P09884 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
POLA1P09884 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.41
POLA1P09884 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
POLA1P09884 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
POLA1P09884 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
POLA1P09884 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
POLA1P09884 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
POLA1P09884 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
POLA1P09884 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
POLA1P09884 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
POLA1P09884 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
POLA1P09884 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
POLA1P09884 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
POLA1P09884 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
POLA1P09884 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
POLA1P09884 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
POLA1P09884 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
POLA1P09884 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
POLA1P09884 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
POLA1P09884 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
POLA1P09884 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms