Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT7P08729 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT7P08729 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT7P08729 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT7P08729 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT7P08729 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT7P08729 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT7P08729 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT7P08729 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT7P08729 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT7P08729 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT7P08729 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT7P08729 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT7P08729 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT7P08729 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT7P08729 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT7P08729 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT7P08729 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT7P08729 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT7P08729 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT7P08729 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT7P08729 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT7P08729 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT7P08729 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT7P08729 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT7P08729 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT7P08729 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT7P08729 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT7P08729 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT7P08729 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT7P08729 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT7P08729 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT7P08729 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT7P08729 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT7P08729 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT7P08729 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT7P08729 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT7P08729 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT7P08729 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT7P08729 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT7P08729 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT7P08729 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT7P08729 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT7P08729 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT7P08729 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT7P08729 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT7P08729 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT7P08729 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms