Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSF1RP07333 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSF1RP07333 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms