Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HLA-DOAP06340 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLA-DOAP06340 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms