Protein–RNA interactions for Protein: P04798

CYP1A1, Cytochrome P450 1A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1A1P04798 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP1A1P04798 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP1A1P04798 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms