Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB4AP04350 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms