Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOEP02649 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOEP02649 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOEP02649 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOEP02649 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOEP02649 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOEP02649 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOEP02649 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOEP02649 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOEP02649 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOEP02649 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOEP02649 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOEP02649 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOEP02649 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOEP02649 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOEP02649 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms