Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNAP02545 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNAP02545 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNAP02545 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNAP02545 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNAP02545 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNAP02545 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNAP02545 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNAP02545 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNAP02545 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNAP02545 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNAP02545 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNAP02545 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNAP02545 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNAP02545 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNAP02545 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNAP02545 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNAP02545 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMNAP02545 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMNAP02545 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMNAP02545 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms