Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV3-33P01772 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IGHV3-33P01772 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms