Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED1O96006 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED1O96006 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms