Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD3O95983 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD3O95983 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD3O95983 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD3O95983 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3O95983 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3O95983 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3O95983 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3O95983 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3O95983 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3O95983 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3O95983 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3O95983 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3O95983 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD3O95983 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3O95983 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3O95983 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3O95983 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3O95983 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3O95983 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3O95983 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3O95983 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3O95983 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3O95983 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD3O95983 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD3O95983 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD3O95983 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD3O95983 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD3O95983 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD3O95983 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD3O95983 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD3O95983 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD3O95983 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD3O95983 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD3O95983 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3O95983 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3O95983 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3O95983 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3O95983 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3O95983 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3O95983 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3O95983 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3O95983 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MBD3O95983 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3O95983 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3O95983 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3O95983 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3O95983 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3O95983 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3O95983 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3O95983 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MBD3O95983 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD3O95983 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD3O95983 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD3O95983 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MBD3O95983 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms