Protein–RNA interactions for Protein: O95954

FTCD, Formimidoyltransferase-cyclodeaminase, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTCDO95954 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FTCDO95954 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FTCDO95954 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FTCDO95954 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FTCDO95954 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FTCDO95954 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FTCDO95954 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FTCDO95954 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FTCDO95954 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FTCDO95954 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FTCDO95954 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FTCDO95954 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FTCDO95954 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FTCDO95954 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FTCDO95954 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FTCDO95954 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FTCDO95954 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FTCDO95954 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FTCDO95954 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FTCDO95954 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms