Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYF2O95926 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYF2O95926 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYF2O95926 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYF2O95926 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYF2O95926 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYF2O95926 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYF2O95926 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYF2O95926 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYF2O95926 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYF2O95926 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYF2O95926 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYF2O95926 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYF2O95926 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYF2O95926 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYF2O95926 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms